Ворцинская миссионерская школа для иноверцев образовалась в 1874 году. В школе работали 1-2 человека, в основном это были молодые женщины и священники-законоучители. Местное население не желало обучать детей грамоте.
В октябре 1917 года все церковно-приходские школы были переведены в ведение Земских управ, в них стали работать законоучителями священники. Так образовалась Ворцинская земская школа.
С 1927 года по 1943 год функционировала как начальная школа, а с 1973 года как средняя. В связи с уменьшением числа обучающихся в 2015 году школа вновь стала основной.
В 1979 году школа переезжает в новое кирпичное двухэтажное здание.
В 1975 году в Ярском районе организовано совместное объединение совхоз - школа для обучения агротехническим приемам по выращиванию льна и ведению опытнической работы. Учащиеся школы в 1979 и 1980 годах являются победителями конкурса юных пахарей. А ученическая производственная бригада по выращиванию льна в 1977-80 годы была одной из лучших в республике.
Пионерская дружина нашей школы в 80-х годах дважды являлась правофланговой в районе, а в 2008 году занесена в районную Книгу Почета пионерских организаций.
В школе с 1998 года успешно претворяется в жизнь воспитательная программа «Шаер». Учащиеся знакомятся с историей окружающих деревень, изучают историю и традиции народа, знакомятся с людьми, выполняют полезную работу по очистке родников. В рамках реализации программы «Шаер» и в результате поисково – исследовательской работы в 2003 году в школе открыт музей бесермянского поэта М.Федотова, нашего выпускника и земляка. В связи с этим наша школа является одним из пунктов районной краеведческой экскурсии, посвященной двум поэтам-землякам: Ф. Васильеву и М. Федотову.
В 2004 году участвовала в Российском образовательном форуме «Модернизация образования как фактор социального развития общества» (республиканский форум), в 2007 году стала лауреатом республиканской образовательной выставки «Образование без границ».
В 2008 году школа принимала участие в республиканском конкурсе лучших школ, реализующих программы модернизации регионального образования, и получила современное оборудование для практических работ в кабинет химии.
Сегодня МБОУ «Ворцинская ООШ» - сельская малокомплектная школа, обучающихся – 8 человек, педагогический состав – 11 человек. Педагоги имеют высшую квалификацию – 9%, 1 квалификационную категорию – 64% , СЗД – 27%. Своевременное освоение новых технологий в преподавании, творческий подход к делу позволяют коллективу добиваться стабильно хороших результатов в работе.